Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TspoP50637 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TspoP50637 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TspoP50637 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TspoP50637 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TspoP50637 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TspoP50637 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TspoP50637 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TspoP50637 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TspoP50637 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms