Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SftpdP50404 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SftpdP50404 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms