Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcls1P49710 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcls1P49710 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms