Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtpreP49446 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtpreP49446 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtpreP49446 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtpreP49446 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms