Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HpdP49429 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HpdP49429 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HpdP49429 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HpdP49429 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HpdP49429 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HpdP49429 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HpdP49429 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HpdP49429 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HpdP49429 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HpdP49429 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms