Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3P48787 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms