Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TgfaP48030 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TgfaP48030 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TgfaP48030 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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