Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rph3aP47708 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms