Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax7P47239 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms