Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sipa1P46062 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sipa1P46062 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms