Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf4P43488 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf4P43488 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms