Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pik3caP42337 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms