Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk3P41971 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elk3P41971 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms