Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tac1P41539 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tac1P41539 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tac1P41539 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tac1P41539 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms