Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rpl28P41105 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rpl28P41105 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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