Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd9P40240 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd9P40240 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms