Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col18a1P39061 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col18a1P39061 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Col18a1P39061 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms