Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lig1P37913 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms