Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
PtprkP35822 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PtprkP35822 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprkP35822 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtprkP35822 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms