Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ercc5P35689 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ercc5P35689 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms