Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PpardP35396 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PpardP35396 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PpardP35396 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PpardP35396 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PpardP35396 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpardP35396 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpardP35396 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpardP35396 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpardP35396 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpardP35396 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PpardP35396 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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