Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab12P35283 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab12P35283 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab12P35283 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab12P35283 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab12P35283 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab12P35283 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab12P35283 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab12P35283 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab12P35283 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab12P35283 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab12P35283 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rab12P35283 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms