Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nedd1P33215 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms