Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxc5P32043 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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