Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Casp2P29594 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Casp2P29594 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms