Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BgnP28653 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BgnP28653 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BgnP28653 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BgnP28653 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BgnP28653 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BgnP28653 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BgnP28653 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BgnP28653 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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