Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd9P28357 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxd9P28357 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms