Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Defa5P28312 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Defa5P28312 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Defa5P28312 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Defa5P28312 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Defa5P28312 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms