Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gja4P28235 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms