Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb3P28231 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms