Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjb1P28230 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb1P28230 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms