Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfraP26618 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms