Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U2af2P26369 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U2af2P26369 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms