Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnna1P26231 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnna1P26231 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms