Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RdxP26043 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RdxP26043 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RdxP26043 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms