Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UbtfP25976 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbtfP25976 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms