Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Olfr1120-201ENSMUST00000058737 1018 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm11871-201ENSMUST00000122429 1061 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd11P23813 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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