Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmnb2P21619 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmnb2P21619 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms