Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm3P21107 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms