Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VimP20152 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VimP20152 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VimP20152 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VimP20152 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VimP20152 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VimP20152 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VimP20152 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VimP20152 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VimP20152 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VimP20152 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms