Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpraP18052 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpraP18052 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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