Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou4f1P17208 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms