Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sptan1P16546 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sptan1P16546 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms