Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp53P15975 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp53P15975 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms