Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SptbP15508 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms