Protein–RNA interactions for Protein: P14869

Rplp0, 60S acidic ribosomal protein P0, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp0P14869 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp0P14869 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp0P14869 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms