Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb1P13372 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms