Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scg5P12961 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg5P12961 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg5P12961 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg5P12961 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms