Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Calb1P12658 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms