Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrm1P12657 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms